Ta izvajalska agencija Komisije upravlja programe EU, ki malim podjetjem pomagajo ohraniti konkurenčnost, kakor tudi programe o raziskavah, okolju, energiji in ribiški industriji.

Izvajalska agencija za inovacije in omrežja upravlja programe EU za infrastrukturo in raziskave na področju prometa, energetike in telekomunikacij.

Evropska izvajalska agencija za izobraževanje in kulturo (EACEA) upravlja financiranje na avdiovizualnem področju in na področju izobraževanja, kulture, mladih, športa, državljanstva in prostovoljstva.

Izvajalska agencija Evropskega raziskovalnega sveta (ERCEA) upravlja programe EU za raziskave.

Izvajalska agencija za raziskave je organ za financiranje na področju raziskav in inovacij. Agencija upravlja nepovratna sredstva EU za raziskave.

Izvajalska agencija za zdravje in digitalno tehnologijo (HaDEA) izhaja iz prizadevanja Evropske komisije za pomoč pri obnovi Evrope po pandemiji COVID-19, ki bo bolj zelena, digitalna, odpornejša in bolje pripravljena na današnje in prihodnje izzive.

Skupno podjetje SESAR 3 se osredotoča na raziskave in inovacije, da bi moderniziralo evropski sistem upravljanja zračnega prometa in pospešilo uveljavljanje digitalnega evropskega neba.

Skupno podjetje za čisti vodik podpira raziskave in inovacije na področju vodikovih tehnologij v Evropi.

Skupno podjetje za čisto letalstvo razvija inovativne tehnologije za zmanjšanje letalskih emisij CO2 in ravni hrupa.

Cilj Skupnega podjetja za evropske železnice je vzpostaviti visoko zmogljivo, prožno, trajnostno, zanesljivo in integrirano železniško omrežje EU za evropske potnike in tovor.

Skupno podjetje za evropsko visokozmogljivostno računalništvo si prizadeva za razvoj vrhunskega superračunalniškega ekosistema v EU.

Skupno podjetje za ključne digitalne tehnologije krepi strateško avtonomijo EU v sektorju elektronskih komponent in sistemov.

Skupno podjetje za krožno Evropo na biološki osnovi si prizadeva za spodbujanje evropskih konkurenčnih industrijskih panog, ki temeljijo na rabi biomase.

Skupno podjetje za pametna omrežja in storitve si prizadeva za usklajevanje raziskav in inovacij na področju tehnologije 6G z državami EU ter spodbuja uvajanje tehnologij 5G v Evropi.

Skupno podjetje za pobudo za inovativno zdravje si prizadeva za prenos zdravstvenih raziskav in inovacij v konkretne koristi za paciente in družbo ter krepitev konkurenčnosti evropske zdravstvene industrije na svetovni ravni.