Kommissionens genomförandeorgan Easme sköter EU-program som ska hjälpa småföretag att klara sig i konkurrensen. Organet har också hand om program för forskning, miljö, energi och fiskenäringen.

Genomförandeorganet för innovation och nätverk sköter EU:s infrastruktur- och forskningsprogram för transport, energi och telekommunikationer.

Genomförandeorganet för Europeiska forskningsrådet sköter EU:s forskningsprogram.

Genomförandeorganet för forskning finansierar forskning och innovation och förvaltar EU:s forskningsbidrag.

Europeiska genomförandeorganet för utbildning och kultur (Eacea) sköter EU-bidragen till utbildning, kultur, audiovisuella frågor, idrott, medborgarskap och frivilligarbete.