Με τη συγκέντρωση πόρων από τις χώρες της ΕΕ, ο προϋπολογισμός της ΕΕ ενισχύει την οικονομία και τη γεωπολιτική θέση της ΕΕ. Βελτιώνει τη ζωή των 450 εκατομμυρίων ανθρώπων που ζουν σήμερα στην ΕΕ.
Οι κυριότερες πηγές χρηματοδότησης του προϋπολογισμού της ΕΕ είναι :
- ποσοστό του ακαθάριστου εθνικού εισοδήματος κάθε χώρας της ΕΕ, με βάση τον πλούτο της
- εισαγωγικοί δασμοί σε προϊόντα που εισάγονται από τρίτες χώρες
- ένα μικρό μέρος του ΦΠΑ που εισπράττεται από κάθε χώρα της ΕΕ
- συνεισφορά με βάση την ποσότητα των μη ανακυκλωμένων απορριμμάτων πλαστικών συσκευασιών σε κάθε χώρα της ΕΕ
Οι πηγές αυτές είναι γνωστές ως «ίδιοι πόροι» της ΕΕ και αποτελούν όλες μαζί τον κυριότερο πόρο του προϋπολογισμού της ΕΕ.
Ο προϋπολογισμός τροφοδοτείται και από άλλα έσοδα, μεταξύ των οποίων, συνεισφορές τρίτων χωρών σε ορισμένα προγράμματα, τόκοι υπερημερίας και πρόστιμα, καθώς και τυχόν πλεόνασμα του προηγούμενου έτους
Ο προϋπολογισμός της ΕΕ βασίζεται στην αρχή ότι οι δαπάνες πρέπει να αντιστοιχούν στα έσοδα, πράγμα που σημαίνει ότι τα ετήσια έσοδα πρέπει να καλύπτουν πλήρως τις ετήσιες δαπάνες.
Επιπλέον, η Ευρωπαϊκή Επιτροπή έχει εξουσιοδοτηθεί, βάσει των Συνθηκών της ΕΕ, να δανείζεται από τις διεθνείς κεφαλαιαγορές εξ ονόματος της ΕΕ. Από το 2021 η Επιτροπή συγκεντρώνει κεφάλαια στις κεφαλαιαγορές για τη χρηματοδότηση του NextGenerationEU, που είναι το πρόγραμμα ανάκαμψης μετά την πανδημία COVID-19. Τα εν λόγω ομόλογα της ΕΕ θα αποπληρωθούν εντός μακράς περιόδου έως το 2058.